Команда "Перцы" создана в 1997 году. В Любительской Футбольной Лиге представленна с начала образования вышеуказанной на тереторрии СВАО, а именно с 2001 года.

Только третий по счету сезон оказался для "Перцев" удачным, после преобразования команды в 2003 году наконецто смогли впервые в своей истории занять призавое 3-е место.